Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP4F12Q9HCS2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms