Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC3GQ9HC16 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms