Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEBOXQ9HB31 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms