Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms