Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms