Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms