Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms