Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms