Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms