Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDC1Q9BTX1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms