Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FYCO1Q9BQS8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms