Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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