Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms