Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NAP1L3Q99457 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NAP1L3Q99457 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms