Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPG4P5Q96PW8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms