Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms