Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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