Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms