Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVB12AQ96EY5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms