Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms