Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTRA1Q92743 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms