Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM9SF4Q92544 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms