Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms