Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms