Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BEST4Q8NFU0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms