Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NGDNQ8NEJ9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms