Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms