Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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