Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms