Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VSIG10Q8N0Z9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG10Q8N0Z9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms