Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms