Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms