Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC103Q8IW40 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms