Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAV3Q8IVL0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms