Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALYREFQ86V81 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms