Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms