Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q71RC1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q71RC1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q71RC1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q71RC1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q71RC1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q71RC1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q71RC1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q71RC1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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