Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC141Q6ZP82 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms