Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms