Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms