Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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