Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATAD2Q6PL18 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD2Q6PL18 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms