Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms