Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms