Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
UFSP1Q6NVU6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms