Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE12Q6L8Q7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE12Q6L8Q7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE12Q6L8Q7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms