Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms