Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD276Q5ZPR3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms