Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFI1BQ5VTD9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms