Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP350Q5VT06 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms